Ο Άγιος Θωμάς είναι ένα από τα πιο ιδιαίτερα και ιστορικά χωριά της κεντρικής Κρήτης, χτισμένο σε υψόμετρο 530 μέτρων στις πλαγιές του όρους Μονοδένδρι, στον νομό Ηρακλείου.