Η Λιμνοδεξαμενή Σχοινιά βρίσκεται στην κεντρική Κρήτη, στον νομό Ηρακλείου, κοντά στον οικισμό Σχοινιάς, σε μια περιοχή με έντονη αγροτική δραστηριότητα.