Η Αρχαία Άπτερα, χτισμένη σε ένα στρατηγικό πλάτωμα πάνω από τον κόλπο της Σούδας, αποτελεί τον πιο επιβλητικό αρχαιολογικό χώρο του νομού Χανίων και μία από τις σημαντικότερες πόλεις-κράτη της αρχαίας Κρήτης.
Η πόλη άκμασε ιδιαίτερα κατά την ελληνιστική και ρωμαϊκή περίοδο, χάρη στον έλεγχο που ασκούσε στα δύο λιμάνια της, τη Μινώα (σημερινή Μαράθι) και την Κισσαμο (σημερινή Καλύβες), αποτελώντας ένα πανίσχυρο εμπορικό και ναυτικό κέντρο της Μεσογείου.
Το πιο εντυπωσιακό χαρακτηριστικό της Άπτερας σήμερα είναι οι γιγαντιαίες ρωμαϊκές δεξαμενές, οι οποίες διατηρούνται σε άριστη κατάσταση. Η αρχιτεκτονική τους, με τις επιβλητικές καμάρες και την τεράστια χωρητικότητα, μαρτυρεί το υψηλό επίπεδο μηχανικής της εποχής και την ανάγκη της πόλης για επάρκεια νερού. Εξίσου σημαντικό είναι το αρχαίο θέατρο, το οποίο έχει αναστηλωθεί σε μεγάλο βαθμό, προσφέροντας μια καθαρή εικόνα της πνευματικής και κοινωνικής ζωής των κατοίκων. Τα «Κυκλώπεια» τείχη που περιβάλλουν τον χώρο, με το τεράστιο μέγεθος των λίθων τους, προκαλούν δέος και υπογραμμίζουν την αμυντική ισχύ της αρχαίας πόλης.
Εκτός από τα αρχαία ερείπια, ο χώρος περιλαμβάνει μνημεία από μεταγενέστερες περιόδους, όπως τη Μονή του Αγίου Ιωάννη του Θεολόγου και το οθωμανικό φρούριο (Κουλές), που χτίστηκε για την προστασία του κόλπου. Η μοναδική θέα προς τα Λευκά Όρη και το Κρητικό πέλαγος, σε συνδυασμό με την πολυεπίπεδη ιστορία του τόπου, καθιστούν την Άπτερα έναν χώρο όπου ο επισκέπτης μπορεί να διαβάσει την ιστορία της Κρήτης μέσα από τα στρώματα των αιώνων.