Το Σπήλαιο του Αγίου Χαραλάμπου βρίσκεται κοντά στο χωριό Άγιος Χαράλαμπος στο Οροπέδιο Λασιθίου.

Ανακαλύφθηκε τυχαία το 1976 κατά τη διάρκεια εργασιών διάνοιξης δρόμου και έχει προκαλέσει το ενδιαφέρον αρχαιολόγων λόγω των ευρημάτων του. Στην περιοχή έχουν βρεθεί οστά, κεραμικά και άλλα αντικείμενα που μαρτυρούν ότι το σπήλαιο χρησιμοποιήθηκε ήδη από τη Νεολιθική και τη Μινωική περίοδο, πιθανώς ως ταφικό ιερό ή οστεοφυλάκιο.