Ο Καλός Ποταμός βρίσκεται στη βορειοανατολική Κρήτη, στον νομό Λασιθίου, στην περιοχή του Ίστρου (Καλό Χωριό), ανατολικά του Αγίου Νικολάου.

Πρόκειται για έναν μικρό, εποχικό ποταμό που διασχίζει μια χαμηλή κοιλάδα και εκβάλλει στη θάλασσα κοντά στις παραλίες της περιοχής, όπως ο Άγιος Παντελεήμονας.

Η ροή του ποταμού εξαρτάται σε μεγάλο βαθμό από τις βροχοπτώσεις. Κατά τη διάρκεια του χειμώνα και μετά από έντονες βροχές, το νερό συγκεντρώνεται στην κοίτη του και κατευθύνεται προς τη θάλασσα, ενώ τους θερινούς μήνες η ροή μειώνεται σημαντικά ή διακόπτεται. Η συμπεριφορά αυτή είναι χαρακτηριστική για τα περισσότερα υδάτινα ρεύματα της ανατολικής Κρήτης.

Παρά το μικρό του μέγεθος, ο Καλός Ποταμός διαμορφώνει ένα ήπιο φυσικό περιβάλλον κατά μήκος της διαδρομής του, με παρουσία καλαμιώνων και χαμηλής παραποτάμιας βλάστησης. Η ύπαρξη νερού, έστω και εποχικά, συμβάλλει στη δημιουργία μιας πιο εύφορης ζώνης σε σχέση με το γύρω, πιο ξηρό τοπίο.

Η κοίτη του ποταμού ακολουθεί μια φυσική διαδρομή μέσα από αγροτικές εκτάσεις και χαμηλούς λόφους πριν καταλήξει στη θάλασσα, όπου σχηματίζει ένα μικρό σημείο εκβολής. Το στοιχείο αυτό προσθέτει ποικιλία στο παράκτιο τοπίο της περιοχής και διαφοροποιεί την εικόνα των κοντινών παραλιών.

Ο Καλός Ποταμός αποτελεί ένα χαρακτηριστικό παράδειγμα των μικρών, τοπικών ποταμών της Κρήτης, που, παρότι δεν έχουν μόνιμη ροή, παίζουν σημαντικό ρόλο στη διαμόρφωση του φυσικού περιβάλλοντος και της γεωμορφολογίας της περιοχής.