Ο Πελεκανιώτικος ποταμός βρίσκεται στη νότια Κρήτη, στον νομό Χανίων, στην ευρύτερη περιοχή του Σελίνου, κοντά στο χωριό Παλαιόχωρα.

Αποτελεί ένα από τα βασικά εποχικά υδάτινα ρεύματα της νότιας ακτογραμμής και εκβάλλει στο Λιβυκό Πέλαγος, στην περιοχή της παραλίας Γραμμένο.

Ο ποταμός πηγάζει από τις νότιες πλαγιές των Λευκών Ορέων και διασχίζει μια ημιορεινή και σχετικά άνυδρη περιοχή πριν καταλήξει στη θάλασσα. Η ροή του εξαρτάται κυρίως από τις χειμερινές βροχοπτώσεις, με αποτέλεσμα να παρουσιάζει αυξημένη παροχή κατά τους υγρούς μήνες, ενώ το καλοκαίρι η κοίτη του παραμένει συνήθως ξηρή.

Κατά μήκος της διαδρομής του, ο Πελεκανιώτικος ποταμός διαμορφώνει μικρές κοιλάδες και συμβάλλει στη δημιουργία τοπικών οικοσυστημάτων. Η παρουσία του νερού, έστω και εποχικά, ευνοεί την ανάπτυξη καλαμιώνων και ανθεκτικής παραποτάμιας βλάστησης.

Στην εκβολή του, κοντά στην παραλία Γραμμένο, το γλυκό νερό συναντά τη θάλασσα, δημιουργώντας ένα ιδιαίτερο φυσικό περιβάλλον που διαφοροποιεί την εικόνα της ακτογραμμής. Η περιοχή διατηρεί έναν ήπιο, φυσικό χαρακτήρα, χωρίς έντονη τουριστική ανάπτυξη.

Ο Πελεκανιώτικος ποταμός αποτελεί χαρακτηριστικό παράδειγμα των εποχικών ποταμών της νότιας Κρήτης, οι οποίοι, παρά τη διακοπτόμενη ροή τους, παίζουν σημαντικό ρόλο στη διαμόρφωση του τοπίου και της τοπικής βιοποικιλότητας.