Η Αγία Αικατερίνη αποτελούσε σιναϊτική μονή που δημιουργήθηκε τον 10ο αιώνα. Είναι ένας χώρος αρκετά σημαντικός καθώς συνδεόταν άρρηκτα με τις τέχνες και τα γράμματα, καθώς εκεί ο Βιτσέντζος Κορνάρος, ο Δομίνικος Θεοτοκόπουλος και άλλοι άνθρωποι των γραμμάτων είχαν εκπαιδευτεί.

Αυτό σταμάτησε με ιδιαίτερα βίαιο τρόπο κατά την επιδρομή των Οθωμανών, όπου και μετατράπηκε σε τζαμί.

Από το 1967 ο ιερός ναός της μονής ο οποίος διατηρήθηκε, στεγάζει το Μουσείο Εικόνων και Κειμηλίων της Ιεράς Αρχιεπισκοπής Κρήτης, όπου φιλοξενούνται εξαιρετικές συλλογές βιβλίων, γλυπτά, τοιχογραφίες και άλλα.